在Shotgun蛋白组学中,虽然质谱仪性能至关重要,但前端样本处理与蛋白酶解策略往往才是决定实验质量的第一道关卡。尤其是在面对复杂、生物学异质性强的样本类型(如组织、体液、临床样本)时,样本前处理策略是否得当,直接影响蛋白提取效率、肽段覆盖度及最终蛋白鉴定数量。 一、样本前处理 1、样本裂解:最大
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Shotgun蛋白质鉴定主要通过底物消化(如胰蛋白酶)将复杂的蛋白质样本裂解为肽段,然后利用液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)进行分析,再通过数据库搜索来推测原始蛋白的组成。这种方法得名于其“霰弹枪式”的分析策略——不是逐个靶向蛋白,而是&ldquo
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酰基化组学(Acylation Proteomics)作为表观遗传学和蛋白质翻译后修饰(PTM)研究的重要组成部分,随着质谱技术的快速发展,酰基化组学研究得以实现对蛋白质上多种酰基修饰的系统性分析,包括乙酰化(Acetylation)、丙酰化(Propionylation)、丁酰化(Butyryla
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